El Instituto de Estudios Nacionales (IDEN) fue creado durante la administración del Rector Abdiel J. Adames, mediante la Resolución 17-86 del 15 de octubre de 1986 del Consejo Académico de la Universidad de Panamá, como un organismo académico dedicado a la investigación, docencia de postgrado, extensión, producción y servicios. Desde sus inicios el IDEN se ha abocado al estudio y análisis de temas de importancia para el desarrollo del país, promoviendo y coordinando investigaciones de carácter inter y multidisciplinario en el campo sociocultural, político, económico, educativo, científico, tecnológico y ambiental.
El IDEN inició labores en enero de 1987 siendo su primera directora la destacada demógrafa panameña Dra. Carmen A. Miró.
Le sucedieron en el cargo:
- el economista Dr. Rubén Laschman (1992);
- el Arq. Luis Eduardo Quiróz Guardia (1993);
- el Mgter. Rubén Darío Rodríguez Patiño (1993);
- el Dr. Miguel González Marco (1993-1994);
- el Prof. Néstor Porcell (1994-1996);
- el Prof. Juan Jované (1996-1999);
- el Dr. Juan Moreno Lobón (2000-2003);
- la Dra. Enilsa Espinosa de Cedeño (2003-2012);
- el Mgter. Dorindo Jayan Cortez (2012-2016);
- el Dr. Filiberto Morales (2016-2019);
- el Prof. Reymundo Gurdián G.
Actualmente la dirección es ejercida por el Dr. Aristides I. Gomez De León
